Не все из этих "базовых" принципов являются базовыми для всех стилей. Особенно 2-ой и 10-ый. На западные стили анимации из-за этой карикатурной гипервыразительности, сейчас, по-моему, только ленивый не ругается.
"аугментацию можно рассматривать и как необходимую часть"

Можно. А можно и не рассматривать. В толкованиях как бы и суть различных суб-культов и ересей внутри системы верований. Тем не менее прямых указаний на обязательную аугментацию в Универсальных Законах, как видишь, нет.
Социальное и иерархическое положение Механикус зависит от знаний и умений. Конечно с парой дополнительных дендритов, выводом информации прямо на сетчатку и храниkищем перфокарт в левой ягодице, ты эффективнее выполняешь свои функции, но если найдётся умелец который может быть сверх-эффективным и без этого, то он и так поднимется, тем более что Механикус фактически выполняют роль всей научно-инженерно-медицинской прослойки Империума, а следовательно есть огромная куча работ, для выполнения которых аугментация особо не поможет.

"Они же должны уподобиться машине откинув плоть по догмам."
НЕТ. ТАКОЙ. ДОГМЫ.
https://wh40k.lexicanum.com/wiki/Universal_Law